Sg1 fait son retour sur Terre après avoir fuit le vaisseau de Thor avant qu'il explose. Le SGC n'aperçoit q'un Réplicateur a survécu au crash du vaisseau Asgard, sg1 de retour ils n'ont plus qu'a trouver une solution pour détruire la menace une fois pour toute.
M04.02 : L'autre côté
Sg1 est envoyé en mission humanitaire afin d'assister les habitants de la planète Euronda. A leur arrivée, ils découvrent une civilisation détruite par la guerre et un leader près à tout pour conclure un accord.
M04.03 : Expérimentation hardeuse
Un délégué du grand conseil Tok'ra 'Anise' remet à sg1 un bracelet suceptble d'octroyer une force surhumaine à celui qui le porte. O'Neill, Carter et Daniel se portent volontaires pour tester l'appareil mais réalisent bientôt qu'ils sont mis à l'épreuve dans une mission qui a pris toutes les apparences d'une mission suicide.
M04.04 : Destins Croisés
Le SGC reçoit la visite de Shaun'Auc une prêtresse jaffa, ex-maitresse de Teal'c. Elle affirme avoir trouver une méthode pour vaincre les goa'uld. En effet en état de quel'norim profond elle a découvert le moyen de communiquer avec son symbiote. Elle pense l'avoir perçoider que les goa'uld était mauvais et demande à être envoyé chez les Tok'ra.
M04.05 : Diviser pour conquérir
Les membres du SGC sont exposés subitement à des pulsions criminelles, la Tok'ra doit trouver un moyen pour contrecarrer l'étrange technologie que les goa'uld qui manipule leurs pensées. Ils sont devenu des Zat'ark...
M04.06 : L'histoire sans fin
Sg1 se retrouve sur la planète P3X-639, avec un homme s'appelait Malikai. Sur cette planète se trouve un dispositif pour remonter dans le temps constrtuit par les Anciens. Une fois actionné le colonel Jack O'Neill et Teal'c se trouvent prient au piège dans une boucle temporelle sans fin... Pourront-ils se sortir de cette situation ?
M04.07 : Eaux troubles
Pour ramener sur Terre une eau aux proprietés étonnantes, les Russes utilisent leur propre 'Stargate'. Mais l'entreprise se termine en catastrophe et, appelée à la rescousse, sg1 découvre que leur Porte des étoiles est restée ouverte.
M04.08 : Primitifs
Après avoir fait une incroyable découverte archéologique, Daniel Jackson est retenu prisonnier par un colosse Unas. O'Neill prend la tête d'une mission de secours et, sur place découvre que la majeure partie d'une équipe SG a été détruite.
M04.09 : Terre brulée
Sg-1 est pris dans un conflit entre deux civilisations qui essayent de coloniser la même planète. Sg-1 étudie la situation et découvre que le vaisseau extraterrestre est entrain de terraformer la planète pour une autre sorte de vie différente de la physiologie humaine.
M04.10 : Sous la glace
Sg1 travaillant pour une station estra-terrestre sans aucun souvenir de leur vie précédente. Alors que le Général Hammond essaie d'éclaircir leur mystérieuse disparition, sg1 tente de rassembler ses souvenirs, seule garantie de leur survie.
M04.11 : Point de non retour
O'Neill fait la rencontre d'un homme étrange qui se dit être un extra-terrestre et qui possède une connaissance troublante 'porte des étoiles'. O'Neill ne prête pas attaention aux propos de cet inoffensif étranger jusqu'a ce qu'une série de coincidences laissent penser que son histoire peut être vraie...
M04.12 : Perdus dans l'espace
Utilisant deux Planeur de la Mort Goa'ulds, les scientifiques de la zone 51 ont créés un vaisseau hle X-301 contenant de la technologique humaine et Goa'uld. O'neill et Teal'c font passés une série de test au nouveau vaisseau lorsque qu'ils sont rapidement entraînés dans l'espace le vaisseau à été modifié par Apophis. Une course contre la montre commence alors pour secourir les deux membres de l'équipe.
M04.13 : La Malédiction
Daniel découvre que son professeur, le Dr Jordan a été tué dans l'explosion de son laboratoire lorsqu'il étudiant la jarre d'Osiris. Jackson voyage jusqu'à Chicago pour assister au funérailles et revoir ses amis et anciens collègues. Il s'aperçoit en voyant la jarre d'Isis, que les deux jarres sont d'origine goa'uld
M04.14 : Le Venin du Serpent
Lorsque Apophis et Her'ur décide de former une alliance, Sg-1 doit essayer de les en empêcher. Teal'c va sur Chulak pour essayer de recruter quelques Jaffas pour lutter contre les Goa'ulds. Sur Terre, Jacob Carter reçoit une transmission des Tok'ras par la Porte des étoiles.
M04.15 : Réaction en chaine
Sg-1 doit faire face à un nouveau commandant, car Hammond à décider de laisser le commandement du SGC, Peu après, O'Neill découvre que un chantage est derrière la démission de Hammond et il doit s'allieravec un ancien ennemi pour être capable de résoudre cette affaire.
M04.16 : 2010
Dix ans dans de futur, Carter et Fraiser découvre un dangereux secret qui menace toute la race humaine. Les anciens membres de Sg-1 se rencontre dans le but d'envoyer un message dans le passé pour éviter cette catastrophe.
M04.17 : Pouvoir Absolu
Dans un tourbillon presque magique, Daniel rencontre l'enfant Harcesis, Shefu L'enfant apprends une leçon à Daniel en lui donnant la connaissance transmise génétiquement par les Goa'ulds. Daniel commence rapidement à abuser de son pouvoir.
M04.18 : La Lumière
Le lieutenant Barber de Sg-5 se suicide en se jetant dans le vortex. Pendant qu'ils enquêtent sur la cause de son suicide, Sg-1 arrive sur une planète où ils trouvent un "centre de villégiature" Goa'uld où ils deviennent hypnotisés par une magnifique et mortelle lumière.
M04.19 : Prodige
Carter essaie de motiver une brillante, mais rebelle étudiante en l'emmenant à travers la Porte des étoiles. Mais cette promenade devient mortelle lorsqu'ils sont attaqués par des êtres de pure énergie. O'neill ordonne l'évacuation, mais les entités leur bloque le chemin.
M04.20 : Entité
Le SGC contacte un monde qui fut découvert grâce au savoir des anciens et envoie une sonde par la Porte. Un virus extraterrestre infiltre les ordinateurs du SGC et ramasse des informations. Croyant le virus détruit, ils découvrent qu'il c'est réfugié dans le corps de Carter.
M04.21: Répliques
Les membres de sg1 reviennent sur une planète 'Juna' qu'ils avaient libérée du joug du goa'uld 'Heru'ur'. Leur première mission sera de convaincre les habitants qu'ils méritent à nouveau leur confiance. Sur place, ils pourront compter sur leurs doubles robotiques, prêt à intervenir, au péril de leur vie, pour les assister dans leur mission.
M04.22 : Exode
Sg1 vole de vaisseau mère de Cronus après la mort de ce dernier sur Juna et le prête au peuple de la Tok'ra. Ils pensent avoir trouvé le moyen de créer une supernova artificielle qui leur permettrait de se débarraser définitivement de la flotte d'Apophis. Mais l'appartion soudaine d'un Al'kesh qui les prend pour cible déjoue ce plan bien huilé. Tandis que leur appareil est gravement endommagé, la destruction du système solaire semble apparament inévitable